A Equipe Hebi chega ao local do esconderijo do Clã Uchiha como foi indicado por Uchiha Itachi à Uchiha Sasuke, Hoshigaki Kisame adverte que somente Uchiha Sasuke poderá passar daquele ponto, os outros deveram esperar a batalha dos Irmãos Uchiha.
Uchiha Itachi pergunta para Uchiha Sasuke o que ele vê, e esse responde que o vê morto. Uchiha Itachi avança e surge atrás de Uchiha Sasuke e diz para ele refazer a sua visão, a batalha começou.

Uchiha Sasuke ataca com sua Espada Kusanagi e Uchiha Itachi com uma Kunai, Uchiha Sasuke usa o Chidori Nagashi no chão, como uma forma de distração e criva sua Espada Kusanagi no abdômen de Uchiha Itachi. Mas era apenas um Genjutsu, Uchiha Itachi não havia saído do trono, Uchiha Itachi diz que o fim dessa batalha está muito longe do fim e pergunta o que é que Uchiha Sasuke deseja, Uchiha Sasuke diz que ele já sabe, e o verdadeiro Uchiha Sasuke, pois o que estava lutando era um Genjutsu, aparece atrás de Uchiha Itachi e criva novamente sua Espada Kusanagi no abdômen. Uchiha Sasuke diz que antes de matá-lo tem uma pergunta: Uchiha Sasuke pergunta quem é o terceiro usuário do Sharingan, quem é esse Uchiha (esse Uchiha foi mencionado por Uchiha Itachi quando esse dizimou o Clã Uchiha), pois Uchiha Sasuke diz que depois de matar Uchiha Itachi irá matá-lo por ter ajudado na dizimação do Clã Uchiha. Uchiha Itachi diz que é Uchiha Madara, um dos fundadores de Konohagakure no Sato e o primeiro usuário do Mangekyou Sharingan, Uchiha Sasuke não acredita e diz que Uchiha Madara deve estar morto, Uchiha Itachi faz Uchiha Sasuke ficar furuioso e lança um Chidori para traz, pois o Uchiha Itachi atacado era novamente um Genjutsu.

Uchiha Itachi diz que percebeu que Uchiha Sasuke ainda não possui o Mangekyou Sharingan, Uchiha Sasuke diz que não precisa dele para matar Uchiha Itachi. Zetsu, que a tudo observa, diz que eles não mexeram um músculo, estão lutando somente por Genjutsu. Uchiha Itachi se levanta e fala que quando Uchiha Sasuke despertar o Mangekyou Sharingan começará a ficar cego progressivamente a cada vez que usá-lo. Uchiha Sasuke pergunta quem afinal é Uchiha Madara, Uchiha Itachi diz que ele foi o primeiro homem a usar o Sharingan para controlar a Kyuubi, foi seu parceiro, seu mestre e que ele é imortal, que Le foi o único Shinobi a descobrir outro segredo do Mangekyou Sharingan, Uchiha Itachi conta a história do Clã Uchiha, onde Uchiha Madara e seu irmão despertaram o Mangekyou Sharingan, e logo dominaram o clã Uchiha, e que quando Uchiha Madara ficou cego arrancou os Mangekyou Sharingan’s de seu irmão e implantou em si, adquirindo o Fuumetsu Mangekyou Sharingan, Uchiha Itachi diz que Uchiha Sasuke será sua nova luz e avança para realmente começar a batalha.

Uchiha Sasuke diz que tornará aquela ilusão da morte de Uchiha Itachi em realidade, com isso Uchiha Sasuke lança diversas Shurikens em Uchiha Itachi que rebate todas com suas Shurikens, Uchiha Itachi segura Uchiha Sasuke e um Kage Bushin, que havia criado, lança Kunais em Uchiha Sasuke, que consegue desviar. Uchiha Itachi consegue avançar sobre Uchiha Sasuke e encurralá-lo em uma parede, e então arranca seus olhos, Uchiha Sasuke desesperado ativa o Juin Nível Dois, que com isso descobre que tudo não passava de um Genjutsu e o desfaz. Zetsu, que a tudo assite, diz que Uchiha Itachi provavelmente venceu, afinal Uchiha Sasuke acabou de receber o Tsukuyomi, mas Uchiha itachi cai ao chão, pois Uchiha Sasuke havia quebrado a sua técnica e saído ileso do ataque, Zetsu diz que Uchiha Itachi havia subestimado Uchiha Sasuke, que diz que com seu ódio por Uchiha Itachi o matará, e Uchiha Itachi diz que tornará realidade a ilusão de arrancar os olhos de Uchiha Sasuke. Zetsu diz que a atmosfera ao redor de Uchiha Itachi está mudando e que isso significa que ele começará a lutar sério, que ele usará o Amaterasu, uma técnica segundo Zetsu que consome tudo o que incostar por sete (7) dias, diz também que a luta por Genjutsus acabou, já que Uchiha Sasuke desfez a ilusão mais poderosa de Uchiha Itachi.

Uchiha Sasuke realiza os selos de mão com uma velocidade incrível, e invoca uma Fuuma Shuriken, utiliza a técnica Kage Shuriken, Uchiha Itachi não consegue completar os elos de mão para realizar o Amaterasu, ma sconsegue desviar das duas Fuuma Shuriken’s, mas Uchiha Sasuke as havia prendido por cabos e controla a direção delas para Uchiha Itachi e o acerta, Zetsu estranha pois diz que Uchiha itachi é capaz o suficiente para escapar desse ataque. Uchiha Itachi sente os efeitos colaterais de usar o Tsukuyomi, Uchiha Sasuke ataca com o Goukakyuu no Jutsu Uchiha itachi desvia mas Uchiha Sasuke ataca com um Chidori lançando-o para o teto do templo, agora os dois lançam um Goukakyuu um contra o outro, as técnicas quase atingem Zetsu, Uchiha Sasuke, devido ao Juin Nível um, consegue empurrar sua técnica para cima de Uchiha Itachi, mas Uchiha Itachi realiza agora o Amaterasu, quem consome as chamas das duas técnicas. Zetsu diz que essas chamas consomem tudo que o lho de Uchiha Itachi focar, Uchiha Itachi direciona seu olhar agora para Uchiha Sasuke, e as chams do Amaterasu se direcionam para o mesmo, e o atingem mas Uchiha Sasuke se protege com sua ‘’asa’’, que se forma quando utiliza o Juin Nível Dois, destruindo-a por completo, Uchiha Itachi para o Amaterasu para proteger os olhos de Uchiha Sasuke, segundo Zetsu. Uchiha Sasuke em sua forma demoníaca, devido ao Juin Nível Dois, lança agora dois Gouryuuka no Jutsu , que raspam em Uchiha Itachi e atingem o teto do Templo Uchiha, Zetsu diz que os dois estão completamente exaustos e quase sem Chakra, Uchiha Sasuke diz que provavelmente esse será seu último Jutsu, Uchiha Itachi diz que pode ver que o Chakra de Uchiha Sasuke está acabando e diz que a técnica que ele usou era do repertório de Orochimaru e que isso consumiu muito Chakra , Zetsu então lembra que Uchiha Sasuke havia absorvido Orochimaru, Uchiha Sasuke diz que o seu Jutsu é como o Amaterasu de Uchiha Itachi, praticamente impossível de se escapar.

Uma tempestade elétrica começa agora no céu sob o Templo Uchiha, Zetsu diz que os Gouryuuka no Jutsu de Uchiha Sasuke eram para preparar a atmosfera necessária para uma tempestade, e não para acertar Uchiha Itachi, diz também que como Uchiha Sasuke está sem c ele canalizará os raios da tempestade na direção de Uchiha Itachi, e segundo Zetsu será muito mais poderos do que se fosse feito com Chakra, e que realmente não é possível escapar desse ataque, já que um raio atinge o solo em um milésimo de segundo. Uchiha Sasuke sobe no teto do templo, e lança seu Kirin em Uchiha Itachi, uma enorme explosão acontece, Uchiha Itachi levanta exausto, mas como se não tivesse recebido o golpe, Uchiha Sasuke retorna à sua forma demoníaca e algo começa a se formar em volta de Uchiha Itachi, uma espécie de exoesqueleto gigante, Uchiha Itachi diz para Uchiha Sasuke observar o último Jutsu dele, o Susano’o.

Uchiha Itachi diz que essa é a terceira técnica, juntamente com Amaterasu e Tsukuyomi que compõe os Três Grandes Deuses do Mangekyou Sharingan. Diz também que se Uchiha Sasuke tem alguma carta na manga, era para usá-la agora. Uchiha Sasuke começa a ouvir uma voz em sua mente dizendo que se ele libertá-lo ele pode ajudar Uchiha Sasuke, e esse sem agüentar mais acaba libertando uma serpente de nove (9) cabeças, Uchiha Itachi reconhece a técnica, é o Jutsu Yamata no Jutsu, Zetsu diz que como Uchiha Sasuke tentou liberar mais Chakra do que tinha, então não tinha como manter Orochimaru preso. As duas técnicas colidem e Orochimaru sai de uma das bocas da hidra (serpente de várias cabeças) e regorjita a Espada Kusanagi dizendo que irá matar Uchiha Itachi e tomará seu corpo, mas a técnica Susano’o de Uchiha itachi atinge Orochimaru com uma espada, e Orochimaru entra em desespero ao reconhecer a espada, Espada de Totsuka, Zetsu explica que a Espada de Totsuka, ou ‘’Katana Sakagari’’, possui um grande poder místico, o de selar qualquer um que seja ferido por ela em um eterno Genjutsu. Com Orochimaru derrotado Uchiha Itachi se dirige à Uchiha Sasuke, mas Uchiha Itachi está quase morrendo, Zetsu diz que o Susano’o gera sérios efeitos colaterais, com isso Uchiha Sasuke lança várias Kunais com Kibakufunda’s presas, mas elas explodem antes de chegar perto de Uchiha Itachi, Zetsu diz que isso dá-se ao fato de outro ítem místico, o Espelho de Yata, um escudo capaz de refletir qualquer ataque, não importando sua velocidade, Uchiha Sasuke é encurralado em uma parede e Uchiha Itachi avança sua mão sobre os olhos de Uchiha Sasuke, mas simplesmente bate com seus dedos na testa de Uchiha Sasuke (como fazia quando eram bons irmãos) e cai morto ao chão, Zetsu fica atonito com o que aconteceu sem entender nada, Uchiha Sasuke ainda em estado de choque cai feliz ao chão, devido ao fato de estar exausto.